Ocena:
Książka jest kompleksowym źródłem informacji dla osób zajmujących się biologią obliczeniową, ze szczególnym naciskiem na praktyczne zastosowania Pythona w bioinformatyce. Obejmuje różnorodne tematy, w tym sekwencjonowanie nowej generacji, genetykę populacji i strukturę białek, oferując przykłady kodu i wyjaśnienia. Wymaga jednak średniej lub wysokiej znajomości języka Python i pewnej znajomości terminologii bioinformatycznej.
Zalety:⬤ Kompleksowe omówienie różnych dziedzin biologii obliczeniowej.
⬤ Zawiera praktyczne porady dotyczące programowania w języku Python i przykłady kodu.
⬤ Aktualna i dobrze zorganizowana treść.
⬤ Przejrzysta i zwięzła prezentacja materiałów.
⬤ Odpowiednia dla średnio zaawansowanych i zaawansowanych użytkowników bioinformatyki.
⬤ Wymaga wcześniejszej znajomości języka Python i terminologii bioinformatycznej.
⬤ Nieodpowiednia dla początkujących w Pythonie lub bioinformatyce.
⬤ Rozdział 1 dotyczący instalacji oprogramowania może być uznany za zbędny przez niektórych użytkowników posiadających wcześniejszą wiedzę.
(na podstawie 6 opinii czytelników)
Bioinformatics with Python Cookbook
Dowiedz się, jak korzystać z nowoczesnych bibliotek i aplikacji bioinformatycznych Pythona, aby prowadzić nowatorskie badania w dziedzinie biologii obliczeniowej.
O tej książce
Odkryj i poznaj najważniejsze biblioteki i aplikacje Pythona do przeprowadzania złożonych analiz bioinformatycznych Koncentruje się na najnowocześniejszych narzędziach do prowadzenia badań z sekwencjonowaniem nowej generacji, genomiką, genetyką populacyjną, filogenomiką i proteomiką Wykorzystuje rzeczywiste przykłady i uczy wdrażania skutecznych metod badawczych.
Dla kogo jest ta książka
Jeśli posiadasz średniozaawansowaną znajomość Pythona i jesteś świadomy głównych badań i słownictwa w interesującym Cię temacie bioinformatyki, ta książka pomoże Ci rozwinąć swoją wiedzę.
Czego się nauczysz
Uzyskać dogłębne zrozumienie podstawowych bibliotek bioinformatycznych Pythona i zapoznać się z najważniejszymi narzędziami do nauki o danych w Pythonie Przetwarzać dane dotyczące całego genomu za pomocą Biopython Analizować i przeprowadzać kontrolę jakości zbiorów danych sekwencjonowania nowej generacji przy użyciu bibliotek takich jak PyVCF lub PySAM Używać DendroPy i Biopython do analizy filogenetycznej Przeprowadzać analizę genetyki populacji na dużych zbiorach danych Symulować złożone demografie i cechy genomowe za pomocą simuPOP
Szczegółowo
Jeśli jesteś biologiem obliczeniowym lub programistą Pythona, prawdopodobnie kojarzysz wyrażenie „gwałtowny wzrost, ekscytujące czasy”. Python jest prawdopodobnie głównym językiem programowania dla dużych zbiorów danych, a zalew danych w biologii, głównie z genomiki i proteomiki, sprawia, że bioinformatyka jest jedną z najbardziej ekscytujących dziedzin nauki o danych.
Korzystając z praktycznych przepisów zawartych w tej książce, będziesz w stanie przeprowadzić praktyczne badania i analizy w biologii obliczeniowej za pomocą Pythona. Omawiamy nowoczesne biblioteki sekwencjonowania nowej generacji i badamy rzeczywiste przykłady, jak radzić sobie z prawdziwymi danymi. Głównym celem książki jest praktyczne zastosowanie bioinformatyki, ale omawiamy również nowoczesne techniki programowania i frameworki do radzenia sobie z coraz większym zalewem danych bioinformatycznych.
