Otwarty dostęp do baz danych i zestawów danych do odkrywania leków

Oryginalny tytuł:

Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery

Zawartość książki:

Otwarty dostęp do baz danych i zbiorów danych na potrzeby odkrywania leków

Aktualne źródło omawiające przyszłość odkrywania leków w oparciu o dane i rosnącą liczbę baz danych o otwartym kodzie źródłowym.

Dzięki przeglądowi 90 swobodnie dostępnych baz danych i zbiorów danych dotyczących wszystkich aspektów projektowania, opracowywania i odkrywania leków, Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery jest kompleksowym przewodnikiem po ogromnej ilości "darmowych danych" dostępnych dla dzisiejszych badaczy farmaceutycznych. Analizowane jest zastosowanie danych open-source do odkrywania i opracowywania leków, a ich przydatność jest oceniana w porównaniu z narzędziami dostępnymi na rynku.

Najistotniejsze bazy danych dotyczące małych cząsteczek, leków i substancji farmakopodobnych, projektowania ligandów, struktur 3D białek (zarówno eksperymentalnych, jak i obliczonych) oraz ludzkich celów leczniczych zostały dogłębnie opisane, wraz z praktycznymi przykładami dostępu do danych i pracy z nimi. Pierwsza część koncentruje się na bazach danych dla małych cząsteczek, a następnie bazach danych dla celów makrocząsteczkowych i chorób. Ostatnia część pokazuje, jak zintegrować różne narzędzia open-source z akademickim i przemysłowym procesem odkrywania i opracowywania leków.

Publikacja Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery, współtworzona i redagowana przez ekspertów z wieloletnim doświadczeniem w tej dziedzinie, zawiera informacje na temat

⬤ Obszerna lista baz danych i zbiorów danych o otwartym dostępie do komputerowego wspomagania projektowania leków.

⬤ PubChem jako chemiczna baza danych do odkrywania leków, DrugBank Online i bioizosteryczny zamiennik do odkrywania leków wspierany przez szwajcarską bazę danych Bioisostere.

⬤ Protein Data Bank (PDB) i dane o strukturze makromolekularnej wspierające wspomagane komputerowo projektowanie leków oraz repozytorium SWISS-MODEL struktur i modeli 3D białek.

⬤  PDB-REDO w projektowaniu leków wspomaganym komputerowo (CADD) oraz wykorzystanie Pharos/TCRD do odkrywania celów leków.

Niezrównany pod względem zakresu i dokładnego przeglądu małych i dużych otwartych źródeł danych istotnych dla racjonalnego projektowania leków, Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery jest niezbędnym źródłem informacji dla chemików medycznych i farmaceutycznych oraz wszystkich naukowców zaangażowanych w odkrywanie i opracowywanie leków.