Aminoglycoside Antibiotic Resistance Through Ribosomal RNA Methylation
U bakterii produkujących antybiotyki dwie rodziny metylotransferaz 16S rRNA (MT) zapewniają oporność na samozatrucie: Kam MT (m1A1408) i Kgm MT (m7G1405). Obie te MT mają swoje homologi w bakteriach chorobotwórczych, odpowiednio w rodzinach Arm i Pam MT.
Te MT działają na nukleotydy w miejscu wiązania antybiotyku, a dodanie grupy metylowej sterycznie blokuje wiązanie antybiotyku. Badania nad Sgm z M. zionensis dostarczyły wstępnych informacji na temat Kgm MT przy użyciu modelowania sekwencji i homologii.
Ostatnie struktury wykazały, że oporne MT, niezależnie od ich pochodzenia, mają ten sam fałd białkowy. Jednak odpowiadające im sekwencje białkowe nie odzwierciedlają zachowania struktury, co wskazuje, że określony fałd białkowy można osiągnąć przy sekwencjach mających zaledwie 30% identyczności.
Jednocześnie zachowanie struktury białka wskazuje, że ograniczenia strukturalne są ważne dla skutecznej selekcji nukleotydów docelowych na 16S rRNA. W przyszłości kluczowym zagadnieniem będzie określenie molekularnego mechanizmu wyboru miejsca docelowego i tego, czy specyficzne cechy rozpoznawania mogą być wykorzystane do zwalczania wzrostu oporności na klinicznie użyteczne antybiotyki aminoglikozydowe.