In Vivo Footprinting: Tom 21

Oryginalny tytuł:

In Vivo Footprinting: Volume 21

Zawartość książki:

Rewolucja w badaniach biologicznych zapoczątkowana przez wykazanie, że poszczególne cząsteczki DNA mogą być izolowane, rekombinowane w nowatorski sposób i wygodnie replikowane do wysokiej liczby kopii in vivo w celu dalszych badań, czyli era rekombinowanego DNA, zrodziła wiele dodatkowych postępów, zarówno metodologicznych, jak i intelektualnych, które w zadziwiającym stopniu poprawiły nasze zrozumienie procesów komórkowych. W ramach późniejszego zalewu informacji, badania nad mechanizmami regulacji genów, zarówno u prokariotów, jak i eukariotów (ale szczególnie tych drugich), były szczególnie dobrze reprezentowane.

Chociaż nie można powiedzieć, że jedno podejście techniczne doprowadziło do obecnego poziomu zaawansowania, zdolność do mapowania interakcji czynników trans-działających z ich sekwencjami rozpoznawania DNA na wysokim poziomie precyzji z pewnością była jednym z ważniejszych postępów. To podejście "footprinting" stało się niemal wszechobecne w badaniach nad regulacją genów. Jednak to właśnie w jego zastosowaniu "in vivo" często można rozwiązać niejasności, nieporozumienia i niespójności, które mogą wynikać z podejścia opartego wyłącznie na "in vitro" i umieścić je we właściwej perspektywie.

Mówiąc prościej, fakt, że można wykazać występowanie interakcji między oczyszczonymi czynnikami a określonym fragmentem DNA w probówce testowej, nie mówi oczywiście nic o tym, czy takie interakcje zachodzą in vivo. Zdolność do badania takich interakcji, gdy zachodzą one wewnątrz komórek, z należytą uwagą zwróconą na odpowiedni etap rozwoju lub na specyficzność tkankową badanej interakcji, sprawiła, że podejście in vivo footprinting stało się nieocenionym dodatkiem do arsenału broni "dżokeja genowego".