Genomika w chmurze Aws: Analiza kodu genetycznego przy użyciu Amazon Web Services

Opinie czytelników

Obecnie brak opinii czytelników. Ocena opiera się na 5 głosach.

Oryginalny tytuł:

Genomics in the Aws Cloud: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services

Zawartość książki:

Analiza genomu i sekwencjonowanie danych z Amazon Web Services

Genomika w chmurze AWS: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services umożliwia osobie, która ma umiarkowaną znajomość AWS Cloud, przeprowadzenie pełnej analizy genomu i badań. Korzystając z informacji zawartych w tej książce, będziesz w stanie pobrać plik FASTQ zawierający nieprzetworzone dane z laboratorium lub plik BAM od usługodawcy i przeprowadzić na nim analizę genomu. Będziesz także w stanie zidentyfikować potencjalnie patogenne sekwencje genów.

⬤ Wprowadzenie do sekwencjonowania całego genomu (WGS)

⬤ Zrozumienie WGS na AWS.

⬤ Opanuj usługi AWS do analizy genomu.

Niektóre kluczowe zalety korzystania z AWS do analizy genomicznej to pomoc naukowcom w wykorzystaniu szerokiego wyboru usług obliczeniowych, które mogą przetwarzać różnorodne zestawy danych w potokach analitycznych. Sekwenatory genomowe, które generują surowe pliki danych, znajdują się w laboratoriach na miejscu, a AWS zapewnia rozwiązania ułatwiające klientom niezawodne i bezpieczne przesyłanie tych plików do AWS. Przechowywanie danych genomicznych i medycznych (np. obrazowanie) na różnych etapach wymaga ogromnej pamięci masowej w opłacalny sposób. Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), Amazon Glacier i Amazon Elastics Block Store (Amazon EBS) zapewniają niezbędne rozwiązania do bezpiecznego przechowywania, zarządzania i skalowania plików genomicznych. Co więcej, usługi pamięci masowej mogą współpracować z różnymi usługami obliczeniowymi AWS w celu przetwarzania tych plików.

Niezależnie od tego, czy dopiero zaczynasz, czy już analizujesz dane genomiczne za pomocą chmury AWS, ta książka zawiera informacje potrzebne do korzystania z usług i funkcji AWS w sposób, który będzie najbardziej sensowny dla twoich badań genomicznych.