Cryoem: Methods and Protocols
Część I - Kriotomografia elektronowa
1. Pierwsze kroki z krioelektronową tomografią in situ.
Daniel Serwas i Karen M. Davies.
2. Tomografia krioelektronowa i automatyczna segmentacja hodowanych neuronów hipokampa.
Ryan K. Hylton, Victoria H. Seader i Matthew T. Swulius.
3. Praktyczne podejścia do frezowania Cryo-FIB i zastosowania w komórkowej tomografii krioelektronowej.
Vinson Lam i Elizabeth Villa.
4. Obrazowanie in situ i określanie struktury kompleksów biomolekularnych przy użyciu tomografii krioelektronowej.
Mohammed Kaplan, William J Nicolas, Wei Zhao, Stephen D Carter, Lauren Ann Metskas, Georges Chreifi, Debnath Ghosal i Grant J. Jensen.
Część II - Analiza pojedynczych cząstek i kriomikroskopia elektronowa.
5. Progress Towards CryoEM: Procedury negatywnego barwienia próbek biologicznych.
Shane Gonen.
6. Konfigurowanie równoległego oświetlenia na Talos Arctica w celu gromadzenia danych o wysokiej rozdzielczości.
Mark A. Herzik, Jr.
7. Multi-body refinement of cryo-EM images in RELION.
Takanori Nakane i Sjors H. W. Scheres.
8. Ocena lokalnej i kierunkowej rozdzielczości map gęstości krio-EM.
Sriram Aiyer, Cheng Zhang, Philp R. Baldwin i Dmitry Lyumkis.
9. Zautomatyzowane modelowanie i walidacja kompleksów białkowych w mapach krio-EM.
Tristan Cragnolini, Aaron Sweeney i Maya Topf.
10. 2D Electron Crystallography of Membrane Protein Single-, Double- and Multi-Layered Ordered Arrays.
Matthew C. Johnson, Yusuf M. Uddin, Kasahun Neselu i Ingeborg Schmidt-Krey.
Część III - Krystalografia elektronowa kryształów 2d.
11. Przygotowanie próbek i gromadzenie danych do badań krystalografii elektronowej struktur białek błonowych i interakcji lipid-białko.
Ka-Yi Chan, Chloe Du Truong, Yu-Ping Poh i Po-Lin Chiu.
12. Analiza pojedynczych cząstek dla krystalografii elektronowej 2D o wysokiej rozdzielczości.
Ricardo Righetto i Henning Stahlberg.
13. Przygotowanie próbki MicroED i gromadzenie danych dla kryształów białek.
Guanhong Bu i Brent L. Nannenga.
CZĘŚĆ IV - DYFRAKCJA ELEKTRONÓW W MIKROKRYSZTAŁACH (MICROED)
14. Wykrywanie mikrokryształów dla CryoEM.
Simon Weiss, Sandra Vergara, Guowu Lin i Guillermo Calero.
15. Low-dose Data Collection and Radiation Damage in MicroED Gromadzenie danych przy niskich dawkach i uszkodzenia radiacyjne w mikroedukacji.
Johan Hattne.
16. Automatyzacja gromadzenia danych z ciągłej rotacji dla MicroED.
M. Jason de la Cruz.
17. Ab initio Determination of Peptide Structures by MicroED.
Chih-Te Zee, Ambarneil Saha, Michael R. Sawaya i Jose A. Rodriguez.