Analiza danych Rna-Seq: Praktyczne podejście

Opinie czytelników

Książka ta jest wysoko ceniona za szczegółowe wprowadzenie do technologii RNAseq, dzięki czemu jest idealna dla początkujących i nauczycieli bioinformatyki. Kompleksowo omawia praktyczne zastosowania, zawiera instrukcje wiersza poleceń i dostarcza rzeczywistych przykładów ułatwiających naukę. Jednak niektórzy użytkownicy zauważyli problemy z dostępnością danych z zalecanych stron internetowych i uważali, że niektóre aspekty techniczne, szczególnie te związane z R, były niedostatecznie reprezentowane.

⬤ Bardzo praktyczny i wszechstronny
⬤ doskonały dla początkujących
⬤ zawiera instrukcje krok po kroku i przykłady z życia
⬤ dobry do nauczania
⬤ samodzielny i obejmuje różne narzędzia i metody RNAseq.

⬤ Nie można było uzyskać dostępu do niektórych zestawów danych
⬤ może nie obejmować wszystkich istotnych narzędzi
⬤ niedostatecznie reprezentowana sekcja na temat R
⬤ bardziej zorientowana na bioinformatyków niż naukowców z mokrego laboratorium.

(na podstawie 15 opinii czytelników)

Oryginalny tytuł:

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Zawartość książki:

Sekwencjonowanie RNA (RNA-seq) oferuje bezprecedensowe informacje na temat transkryptomu, ale wykorzystanie tych informacji za pomocą narzędzi bioinformatycznych jest zazwyczaj wąskim gardłem. RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach umożliwia naukowcom badanie zróżnicowanej ekspresji na poziomie genów, eksonów i transkryptów oraz odkrywanie nowych genów, transkryptów i całych transkryptomów.

Każdy rozdział rozpoczyna się od podstaw teoretycznych, po których następują opisy odpowiednich narzędzi analitycznych i praktyczne przykłady. Dostępne zarówno dla bioinformatyków, jak i nieprogramujących naukowców z mokrego laboratorium, przykłady ilustrują użycie narzędzi wiersza poleceń, R i innych narzędzi open source, takich jak graficzne oprogramowanie Chipster.

Prowadząc czytelników przez cały proces analizy danych, ten samodzielny przewodnik zapewnia szczegółowy przegląd głównych metod analizy danych RNA-seq i wyjaśnia, jak z nich korzystać w praktyce. Jest on odpowiedni dla badaczy z różnych środowisk, w tym biologii, medycyny, genetyki i informatyki. Książka może być również wykorzystywana na studiach magisterskich lub zaawansowanych studiach licencjackich.