Analityka systemowa i integracja dużych danych omicznych

Oryginalny tytuł:

Systems Analytics and Integration of Big Omics Data

Zawartość książki:

"Genotyp" jest zasadniczo pełną dziedziczną informacją organizmu uzyskaną od jego rodziców. "Fenotyp" to rzeczywiste obserwowane właściwości fizyczne i behawioralne organizmu.

Mogą one obejmować cechy takie jak morfologia, rozmiar, wzrost, kolor oczu, metabolizm itp. Jednym z pilnych wyzwań w biologii obliczeniowej i systemowej jest przewidywanie zależności między genotypem a fenotypem. Jest to trudne, biorąc pod uwagę ilość danych generowanych przez nowoczesne technologie Omics.

Te "Big Data" są tak duże i złożone, że tradycyjne aplikacje do przetwarzania danych nie są w stanie sprostać temu zadaniu. Wyzwania pojawiają się w zakresie gromadzenia, analizy, eksploracji, udostępniania, przesyłania, wizualizacji, archiwizacji i integracji tych danych.

W tym wydaniu specjalnym skupiono się na analizie danych Omics na poziomie systemowym, najnowszych osiągnięciach w zakresie adnotacji ontologii genów oraz postępach w zakresie ścieżek biologicznych i biologii sieci. Badana jest integracja danych Omics z danymi klinicznymi i biomedycznymi przy użyciu uczenia maszynowego.

Niniejszy numer specjalny obejmuje nowe metodologie w kontekście interakcji gen-środowisko, ekspresji genów specyficznych dla tkanek oraz wpływu czynników zewnętrznych lub genetyki gospodarza na mikrobiom.