Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille
W niniejszej pracy przyjęto podejście in silico do identyfikacji i charakterystyki miRNA konserwowanych w tagach sekwencji wyrażonych soczewicy (EST). W celu identyfikacji nowych miRNA w soczewicy, sekwencje EST zostały przeszukane pod kątem homologii ze znanymi dojrzałymi miRNA z królestwa roślin Viridiplantae przy użyciu BLASTN online.
Identyfikacja obliczeniowa oparta na genomice porównawczej dała 12 potencjalnych kandydatów na miRNA należących do 12 różnych rodzin miRNA w soczewce. Wreszcie, wykorzystując potencjalne miRNA w soczewce, przewidziano łącznie 25 genów docelowych i zilustrowano ich prawdopodobne funkcje.
Większość genów docelowych miRNA soczewki wydaje się kodować wzrost, rozwój, metabolizm i odpowiedź na stres, odporność na choroby itp. W niedalekiej przyszłości lepsze zrozumienie mechanizmów molekularnych miRNA w soczewicy może pomóc w opracowaniu nowej i precyzyjnej techniki zrozumienia niektórych potranskrypcyjnych mechanizmów wyciszania genów w odpowiedzi na tolerancję stresu.